1 · 上传图片
选择或拖入 TIFF、PNG 或 JPEG。计算在这台浏览器里完成,图片不上传。使用自己的图片需要先登录,目前不扣积分。没有图时,可以先用示例走一遍,不用登录。
做 Western blot 灰度分析:自动检出泳道和条带,计算相对积分光密度,不必在 ImageJ 里逐条手框。上传成像仪导出的 TIFF;PNG 和 JPEG 也可以打开。TIFF 用文件里的采样值,PNG 和 JPEG 用浏览器解码后的 8 位像素。
使用步骤
自动检出泳道和条带,用条带旁边的背景计算相对积分光密度。TIFF、PNG、JPEG 都可以打开,用来代替在 ImageJ 里逐条手框。框可以改,结果可以导出。
选择或拖入 TIFF、PNG 或 JPEG。计算在这台浏览器里完成,图片不上传。使用自己的图片需要先登录,目前不扣积分。没有图时,可以先用示例走一遍,不用登录。
框住要定量的那一行,上下留一点膜,也可以直接用整张图。接着填写实际点了几条泳道,用来核对检出条数。不确定时可以跳过。
拖框改位置,拖边改宽高。漏检处点「添加条带」。点「合并」后再点要合成的两条带。点「拆分」把当前泳道分成左右两列。多出来的条带可以剔除,误剔可以恢复。
确认后可下载 CSV、Excel 和带框的标注图,并复制一段方法描述。数值是相对积分光密度,只在这张图里比较,没有做内参归一。
支持 TIFF、PNG 和 JPEG,单张不超过 40 MB。TIFF 读取文件里的采样值,支持未压缩和 PackBits 的 8、16 或 32 位图,暂不支持 LZW 压缩。PNG 和 JPEG 用浏览器解码后的 8 位像素。优先用成像仪导出的 16 位 TIFF。JPEG 可以打开,但压缩已经改过像素,数字只作参考。
用自己的印迹图片需要先登录,目前检测、改框和导出都不扣积分。用示例图不用登录。
可以。点击「用示例图试一次」,不用登录就能完成裁剪、核对泳道数、改框和导出。示例是程序生成的条带,用来熟悉步骤。
需要核对。很淡或间距不匀的带可能漏检,过曝的带可能粘在一起。请对照实际点样数,用添加、剔除、合并或拆分改完再使用结果。在公开膜上,与 ImageJ Gel Analyzer 的泳道剖面相比,较强条带的强弱次序一致;这不是对每张膜的误差保证。
添加:点「添加条带」,再点漏检的位置,然后拖框改位置、拖边改宽高。合并:点「合并」,再依次点两条带;两条带中间不能隔着别的条带。拆分:先选中一条,再点「拆分」,会分成左右两列。还没在图上点下去时,按 Esc 或点「取消」可以退出添加或合并。
积分光密度是框内像素减去背景后的有符号求和。背景是这条带上下、且不落在其他条带框里的邻近行的中位数。单位是任意单位,只在同一张图内比较,没有按内参归一。条带内部如果有像素顶到测量端,方法描述里会注明积分可能偏低。